ناینگولان در ژانویه به عنوان بخشی از تحقیقات دادستانی بروکسل درباره یک شبکه قاچاق مواد مخدر از آمریکای جنوبی به اروپا دستگیر شد. او یک شب را در زندان گذراند و خودروی شخصیباند جنایی بود.
بازداشت ناینگولان همزمان با انجام ۳۰ عملیات پلیس از سوی نیروهای بروکسل در صبح روز دوشنبه در مناطق مختلف بروکسل و آنتورپ صورت گرفت. این حادثه فصل جنجالی دیگری به دوران حرفهای پرحاشیه این فوتبالیست اضافه کرد که دوران ورزشیاش همیشه با مسائل انضباطی همراه بوده است.
در سال ۲۰۱۸، در حالی که برای رم بازی میکرد، انتشار یک ویدئو در شبکههای اجتماعی، که وی را در حالت مستی نشان میداد، منجر به کنار گذاشته شدن او از تیم و جریمه شد. همچنین در سال ۲۰۲۲، در دوران حضور او در رویال آنتورپ، پس از مشاهده وی در حال استعمال سیگار الکترونیکی روی نیمکت ذخیرهها، باشگاه وی را محروم کرد. این اقدام از سوی باشگاه بهعنوان الگویی نامناسب برای بازیکنان جوان توصیف شد.
با وجود مسائل اخیر، باشگاه لوکرن که ناینگولان در حال حاضر در آن بازی میکند، بهطور علنی از او دفاع کرده است. ون دویسن ، رییس این باشگاه، تاکید کرد که تمامی تخلفات فعلی، صرفاً اتهام بوده و این بازیکن فقط در صورت اثبات این اتهامات باید مجازات شود.
او در گفتگو با HLN گفت: «هنوز هیچ اتهام رسمیای علیه او مطرح نشده است و حتی حکمی در مرحله اول یا تجدیدنظر صادر نشده است. بنابراین، نمیتوان فرض کرد که پنج سال زندان در انتظار اوست. خوشبختانه ما هنوز در کشوری قانونمند زندگی میکنیم و هر فردی تا زمانی که جرمش ثابت نشده بیگناه است. راجا حق دارد از یک دادرسی عادلانه برخوردار باشد.»
ون دویسن همچنین به توجه منفی رسانهها به این پرونده به دلیل شهرت ناینگولان اشاره کرد و افزود: «این وضعیت خوشایند نیست. ما باشگاهی هستیم که سطحی از دیده شدن و پوشش رسانهای را داریم. اگر راجا بازیکنی گمنام بود، کسی تماس نمیگرفت. اما چون او یک بازیکن سابق تیم ملی بلژیک است، سابقهای رسانهای دارد.»
نام ناینگولان در این پرونده قاچاق مواد مخدر مطرح شده است اما ظاهراً او مظنون به مشارکت مستقیم در عملیات نمیباشد. ارتباط نام او با این پرونده از آنجا ناشی میشود که مشخص شده مبلغ ۱۰۵ هزار و ۵۰۰ یورو نقدی از نصرالدین سکاکی، متهم اصلی این پرونده، دریافت کرده است. در آن زمان، حسابهای بانکی این فوتبالیست مشهور به دلیل روند طلاق ش مسدود شده بوده و او به طور موقت به داراییهای شخصی خود دسترسی نداشته است.